Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms