Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms