Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9V4

Rsph9, Radial spoke head protein 9 homolog, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph9Q9D9V4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rsph9Q9D9V4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rsph9Q9D9V4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rsph9Q9D9V4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rsph9Q9D9V4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rsph9Q9D9V4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rsph9Q9D9V4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rsph9Q9D9V4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rsph9Q9D9V4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rsph9Q9D9V4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rsph9Q9D9V4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rsph9Q9D9V4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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