Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms