Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T0

Fam3a, Protein FAM3A, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3aQ9D8T0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam3aQ9D8T0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam3aQ9D8T0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam3aQ9D8T0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam3aQ9D8T0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam3aQ9D8T0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam3aQ9D8T0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam3aQ9D8T0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam3aQ9D8T0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam3aQ9D8T0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam3aQ9D8T0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam3aQ9D8T0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam3aQ9D8T0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam3aQ9D8T0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam3aQ9D8T0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam3aQ9D8T0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam3aQ9D8T0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam3aQ9D8T0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam3aQ9D8T0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam3aQ9D8T0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam3aQ9D8T0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam3aQ9D8T0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam3aQ9D8T0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam3aQ9D8T0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam3aQ9D8T0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam3aQ9D8T0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam3aQ9D8T0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam3aQ9D8T0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam3aQ9D8T0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam3aQ9D8T0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam3aQ9D8T0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam3aQ9D8T0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam3aQ9D8T0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam3aQ9D8T0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam3aQ9D8T0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms