Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Capns2Q9D7J7 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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