Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptp4a3Q9D658 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms