Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms