Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms