Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2X0

Ankrd39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd39Q9D2X0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ankrd39Q9D2X0 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ankrd39Q9D2X0 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ankrd39Q9D2X0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ankrd39Q9D2X0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ankrd39Q9D2X0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ankrd39Q9D2X0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ankrd39Q9D2X0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ankrd39Q9D2X0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ankrd39Q9D2X0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ankrd39Q9D2X0 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ankrd39Q9D2X0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ankrd39Q9D2X0 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ankrd39Q9D2X0 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ankrd39Q9D2X0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ankrd39Q9D2X0 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ankrd39Q9D2X0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ankrd39Q9D2X0 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ankrd39Q9D2X0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ankrd39Q9D2X0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ankrd39Q9D2X0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ankrd39Q9D2X0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ankrd39Q9D2X0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ankrd39Q9D2X0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms