Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms