Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Krtap5-3Q9D226 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Krtap5-3Q9D226 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Krtap5-3Q9D226 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Krtap5-3Q9D226 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Krtap5-3Q9D226 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krtap5-3Q9D226 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krtap5-3Q9D226 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krtap5-3Q9D226 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Krtap5-3Q9D226 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Krtap5-3Q9D226 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Krtap5-3Q9D226 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms