Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx17Q9D0I4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms