Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc5Q9D0F6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc5Q9D0F6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc5Q9D0F6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Rfc5Q9D0F6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Rfc5Q9D0F6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Rfc5Q9D0F6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc5Q9D0F6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc5Q9D0F6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc5Q9D0F6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc5Q9D0F6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc5Q9D0F6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc5Q9D0F6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc5Q9D0F6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc5Q9D0F6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc5Q9D0F6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Rfc5Q9D0F6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc5Q9D0F6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Rfc5Q9D0F6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc5Q9D0F6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc5Q9D0F6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc5Q9D0F6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc5Q9D0F6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Rfc5Q9D0F6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc5Q9D0F6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc5Q9D0F6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Rfc5Q9D0F6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc5Q9D0F6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Rfc5Q9D0F6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc5Q9D0F6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc5Q9D0F6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc5Q9D0F6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc5Q9D0F6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc5Q9D0F6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc5Q9D0F6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc5Q9D0F6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc5Q9D0F6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc5Q9D0F6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc5Q9D0F6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc5Q9D0F6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc5Q9D0F6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc5Q9D0F6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc5Q9D0F6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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