Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Mms19Q9D071 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Mms19Q9D071 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Mms19Q9D071 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Mms19Q9D071 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Mms19Q9D071 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Mms19Q9D071 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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Mms19Q9D071 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Mms19Q9D071 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms