Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrs1Q9CYH6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms