Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms