Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Xrcc3Q9CXE6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Xrcc3Q9CXE6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Xrcc3Q9CXE6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Xrcc3Q9CXE6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Xrcc3Q9CXE6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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