Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Tdrd12Q9CWU0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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Tdrd12Q9CWU0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Tdrd12Q9CWU0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Tdrd12Q9CWU0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Tdrd12Q9CWU0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Tdrd12Q9CWU0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Tdrd12Q9CWU0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms