Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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