Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX5

Cldnd1, Claudin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd1Q9CQX5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd1Q9CQX5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms