Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rdm1Q9CQK3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rdm1Q9CQK3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rdm1Q9CQK3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rdm1Q9CQK3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rdm1Q9CQK3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rdm1Q9CQK3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rdm1Q9CQK3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rdm1Q9CQK3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rdm1Q9CQK3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rdm1Q9CQK3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rdm1Q9CQK3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rdm1Q9CQK3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms