Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms