Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms