Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Ms4a4dQ99N05 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Ms4a4dQ99N05 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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