Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms