Protein–RNA interactions for Protein: Q99MJ6

Pdzd3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd3Q99MJ6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd3Q99MJ6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms