Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms