Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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