Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms