Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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