Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms