Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ddb2Q99J79 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ddb2Q99J79 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ddb2Q99J79 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ddb2Q99J79 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ddb2Q99J79 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ddb2Q99J79 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ddb2Q99J79 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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