Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms