Protein–RNA interactions for Protein: Q925N1

Sfxn4, Sideroflexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn4Q925N1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfxn4Q925N1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms