Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms