Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms