Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms