Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms