Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rprd1aQ8VDS4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms