Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Uhrf1Q8VDF2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Uhrf1Q8VDF2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Uhrf1Q8VDF2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Uhrf1Q8VDF2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Uhrf1Q8VDF2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Uhrf1Q8VDF2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Uhrf1Q8VDF2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Uhrf1Q8VDF2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Uhrf1Q8VDF2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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