Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc8Q8VD72 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms