Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBZ3

Clptm1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clptm1Q8VBZ3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clptm1Q8VBZ3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms