Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Vmn1r200Q8R281 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Vmn1r200Q8R281 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Vmn1r200Q8R281 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Vmn1r200Q8R281 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Vmn1r200Q8R281 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Vmn1r200Q8R281 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Vmn1r200Q8R281 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Vmn1r200Q8R281 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Vmn1r200Q8R281 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Vmn1r200Q8R281 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Vmn1r200Q8R281 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Vmn1r200Q8R281 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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