Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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