Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4N3

Defb12, Beta-defensin 12, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb12Q8K4N3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Defb12Q8K4N3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defb12Q8K4N3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms