Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm1Q8K377 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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