Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms