Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trip10Q8CJ53 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms