Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Card11Q8CIS0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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Card11Q8CIS0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Card11Q8CIS0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms